在全国政协9月6日召开的专题协商会上，全国政协常委、九三学社中央常委张涛说，多年来，科技界一直强烈呼吁加强科技工作的顶层设计，强化科技工作的宏观管理。在这里提六点建议。第一，解决机制问题是当务之急。在纲要战略研究阶段，专家们已经提出科技体制改革在实施纲要中的极端重要性，同时更认识到其艰巨性。但由于难度太大，纲要暂时搁置了这些问题，留待纲要实施过程中逐步解决。机制问题不是远期目标，而是当前科技体制改革的当务之急，如果迟迟不能解决，势必影响建立创新型国家的进程。体制改革任务之艰巨，其实质无非是部门利益之争，中共中央国务院有责任要求各级领导干部从建设创新型国家的战略目标出发，从“讲政治”的高度出发，彻底摒弃“屁股指挥脑袋”的狭隘部门观念，服从大局，服从有利于提高整个国家创新能力的制度设计。第二，深化科技体制改革，优化科技资源配置。建议成立高层次的统领全国自主创新工作的决策机构，比如成立由国务院和中央军委各相关部门、各民主党派中央和全国工商联以及社会团体参加的“建设创新型国家战略指导委员会”，下设执行机构，摒弃部门利益，研究制定相关政策，以整合经济和科技部门的工作，统一领导经济和科技体制以及其它方面的综合改革。第三，在中共中央统一领导下，围绕国家整体利益，以提高效益为原则，通过深化改革重新整合并优化配置包括第一生产力在内的各种国有经济要素。除了涉及国家安全等公益性科技项目由政府安排精干的科研单位具体实施之外，其它方面的领域非常宽泛的国有科研资源都应整合到高校或企业里，尽量精简独立于高校和企业之外的国有科研单位，以提高我国科技资源效益和竞争力。第四，要充分发挥行业协会和专业学会在科技创新中的作用。 第五，发动全民参与创新型国家建设。第六，政府部门提出的一些观点要符合辩证唯物主义和历史唯物主义，要经得起历史和实践的检验，不能因为部门利益的干扰而倡导一些非常片面甚至错误的认识和提法。尤其要避免基于那些片面和错误认识的政府决策。诸如“知识创新”和“技术创新”，“上游”与“下游”的提法等都值得推敲。