5月13日上午，南京石子岗殡仪馆告别大厅及广场花圈似海，挽联如潮。1300余人来到这里，痛别我国水利工程界的泰斗、水利高等教育的一代宗师、河海大学名誉校长严恺院士。严恺院士因病于2006年5月7日凌晨在南京逝世，享年94岁。告别大厅里哀乐低回，严恺院士的遗体安卧在鲜花翠柏丛中，身上覆盖着中国共产党党旗，人们依次缓步走到遗体面前三鞠躬，默默地与严恺院士道别。

严恺院士逝世以后，九三学社中央委员会和全国人大常委会副委员长、九三学社中央主席韩启德分别发来唁电并送来花圈，对严恺院士的逝世表示沉痛哀悼，并向其亲属致以亲切问候。

中共江苏省委统战部部长周珉、副部长李熙诚，九三学社江苏省委名誉主委彭司勋、副主委穆西南、史苑芗，原副主委李一鸣等参加了严恺告别仪式，并向严恺亲属表示了慰问。