九三学社中央高度重视提高政协提案质量。２００４年，九三学社十一届七次中央常委会研究通过的《九三学社中央关于加强参政议政工作的若干意见》强调，要在参政议政工作中树立以质量取胜的观念，增强精品意识，落实质量要求，建立科学的参政议政评价标准。意见还从“抓好选题”、“凝聚焦点”、“强化特色”、“加强基础研究”等方面对提高参政议政质量提出了具体措施。近年来九三学社中央提案质量不断提高。例如，２００５年全国政协提案委员会上报中央３９件提案，其中各民主党派中央和全国工商联２１件，九三学社中央占５件，约占总数的八分之一；２００６年全国政协十届四次会议期间，全国政协安排的两次提案现场办理座谈会，都有九三学社中央的提案参加；２００７年全国政协十届五次会议期间召开的“广泛运用现代科学技术，推进社会主义新农村建设”提案现场办理协商会，九三学社中央《关于利用现代信息技术促进农民增收的建议》等３件提案入选，为历年提案现场协商会入选提案最多的一次。本届政协期间，九三学社中央共有２０件提案入选政协《重要提案摘报》，其中５件提案得到中央领导同志的批示；有１１件提案被全国政协提案委员会列为重点提案召开协商办理座谈会；有１０件提案被提案承办单位列为重点提案上门回访或召开座谈会协商办理。

近年来，九三学社在提高提案质量方面主要有以下体会：一、抓好提案选题。要围绕党和国家的中心工作确定并及时调整选题，紧跟形势，既抓热点也抓冷点。二、实行“上下互动”。所谓“上下互动”，是指九三学社中央和地方组织通过自下而上和自上而下的相互作用提升参政议政工作效果，通过课题招标、提案征集等方式形成一批高质量提案。三、体现科技特色。九三学社是以科技界人士为主体的参政党。发挥科技优势、体现科技特色一直是九三学社提高提案质量所追求的目标。十届政协以来，九三学社中央相继提出《关于实施国家知识产权战略的建议》、《关于加快发展我国软件产业的建议》、《我国基础研究管理体制和机制中的问题和对策》、《关于加强对企业技术创新优惠政策落实的建议》等提案，产生了积极的影响和作用。如２００３年九三学社中央在全国政协大会上提出了《关于实施国家知识产权战略的建议案》，产生了积极的影响和作用。后来国务院成立了由吴仪副总理任组长的实施国家知识产权战略领导小组，制定了相关文件。２００６年九三学社中央提出《关于实施国家知识产权战略的建议》，受到国家知识产权局的高度评价。